组合式空调机组按结构型式分类，可分为卧式、立式和吊顶式；按用途特征分类，可分为通用机组、新风机组、净化机组和专用机组（如屋顶机组、地铁用机组和计算机房专用机组等等）；还可以按规格分类，机组的基本规格可用额定风量表示。
组合式空调机组功能段的设置要根据生产工艺或洁净室要求确定，这是基本原则。净化机组功能段的合并及取舍要与空调房的设计紧密结合起来。必须对净化机组中的微生物污染点进行控制。组合式空调机组由于结构、温湿度较适宜细菌等微生物的滋长，净化机组的箱体、过滤器、消声器、加湿器等成了潜在的微生物污染点，必须对其进行控制。
过滤段 有初、中效过滤两种，配有菱形袋式，四峰袋式，也可配用自动卷绕式，滤料用优质涤轮无纺布，并采用过滤器装拆机构，压盖显示及报警装置。